Si vous parlez de déplacer les fichiers natifs de windows,il est possible de le faire mais à ce moment windows recrée le fichiers déplacé à sa position d'origine.Donc exemple si vous déplacé le dossier Document sur une autre partition windows recréera sur C un nouveau dossier Document et vous vous retrouverez avec 2 dossiers document et la possibilité que windows en perde le chemin.
J'ai déja tenté cette manipulation avec des résultats malheureux.
Il est donc recommandé de garder la configuration de windows intacte et si vos fichiers sont un peu mélangés et bien il s'agit alors d'y mettre un peu d'ordre.Vos fichiers personnels peuvent être eux déplacés sans autres danger que de ne plus s'y retrouver si votre classement est un peu désordonné.